А вот совсем иная картина на 1 кГц и на 100 Гц. В чем может быть причина?
Полагаю, где-то микрофонный эффект. У меня, когда генератор на поролоне стоит, тоже слегка +-3 кГц видны - см. картинку на 16 МГц, но уровень там совсем маленький.
Не исключаю, кстати, что это что-то с опорника на SI прилетает по проводам, как-то видел уже такое.
Или же, у Вас петля ФАПЧ заводится, поиграйте там ёмкостями, если палки не сдвинутся, то, значит, не в ФАПЧе дело...