Ок. Допустим транс от полумоста, первичка сетевая. Вторична на 5 вольт.
В таком трансформаторе незачем определять полярность вторичной. Вторичная обмотка симметричная, нагружена на двухполупериодный выпрямитель, так что там не важна полярность. Если обмотка разъединена по средней точке, тогда да, надо определить, где какой вывод. Для этого два вывода соединяете вместе и определяете выходное напряжение на крайних выводах. Если там близко к нулю, значит включили не правильно. Что касается обратноходового и пр. Я думаю, озадачиваться полярностью, это минимум. А определять надо намного больше параметров.
Часто пользуюсь осциллографом. Двухлучевой. Дает возможность видеть напряжение на первичной обмотке, также на вторичной. Показывает полярность, соотношение витков. Если подать прямоугольный сигнал, с регулируемой скважностью, можно увидеть время нарастания тока в обмотке, отсюда индуктивность. А если генератор мощный (тот же обратноходовой выходной каскад) то можно видеть и когда сердечник насыщается и пр. Так что тут не все просто, если действительно хочется много узнать.