Какой программе верить?
Я не пользуюсь ни той, ни другой - снимаю АЧХ с помощью Rigol DSA 815, нахожу частоты резонансов, затем меряю параллельную ёмкость Cp любым измерительным прибором на низкой частоте. После этого ввожу данные в свою пресету, и вычисляю все параметры кварца.
Что там меряют указанные Вами изделия - не знаю. Совершенно не исключаю, что ложного всплеска у Вашего КФ нет, а это просто глюк измерителя.
Совершенно не вопрос математически вычислить АЧХ Вашего фильтра, но для этого нужно точно знать параметры всех входящих в него кварцев.
Кроме того, любой кварц имеет помимо основного ещё паразитные последовательные резонансы, если они находятся совсем близко к основному (ближе +-5 кГц), я бы такие кварцы в КФ не ставил.