Как я понял, нужно две частоты, скажем 28000, с разносом 2-3 кГц.

К примеру, так. 

И подойдет ли НаноВна с внешней антенной в качестве анализатора?

Я не в курсе, как этот прибор работает в качестве анализатора спектра. 

При каком КСВ должна срабатывать защита? Сейчас я перестраховался и защита срабатывает при КСВ >2.

Так это Вам решать, я обычно датчик обратной волны после ФНЧ ставлю на отражёнку, при КСВ=1.5 при полной мощности. 
При меньших мощностях, допустимый КСВ, естественно, растёт.

Еще диски надо хранить при влажности 40-50%. Не пересушивать. Не царапать. Диск по сути как винил. Если условия соблюдены это надежная вещица.

К сожалению пока нечем Придется спаять что-то на 2-х кварцевых резонаторах. Как я понял, нужно две частоты, скажем 28000, с разносом 2-3 кГц.
Я еще почитаю форум на этот предмет. По крайней мере корреспондент дословно сказал: "Эх, у всех бы был такой сигнал..."
И подойдет ли НаноВна с внешней антенной в качестве анализатора? В смысле антенна меньше лямбда/10 на второй вход и полоса 1-2 МГц.
Да, еще вопрос... При каком КСВ должна срабатывать защита? Сейчас я перестраховался и защита срабатывает при КСВ >2.

От прожигающего привода зависит и от качества дисков.

Несомненно. 
В Nero, как помню, можно было разные режимы прожига ставить...

Давным давно взрослые дяденьки говорили так, если не издеваться над лампой, то с неё можно получить мощность в два раза большн мощности рассеиваемой анодом. Для 6П45С это 35Вт, номинально 70Вт. Вы получили по 100Вт на лампу. Прекрасный показатель, остальное от лукавого.